La estructura orgánica de ISA está directamente vinculada con la naturaleza de sus actividades especializadas. Cuenta con un reducido cuerpo directivo que se encarga directamente de las labores de diseño y análisis de información producto de estudios de opinión pública; y que encabeza y vigila el funcionamiento de los grupos de operación para el levantamiento y procesamiento de datos. 

Su estructura directiva actualmente incluye la Presidencia Ejecutiva, la Dirección General, una Dirección Operativa y una Dirección de Análisis, además de una Coordinación Administrativa, contando con los cuadros de apoyo requeridos para la operación regular de la empresa, con experiencia en la conducción de estudios cuantitativos en el campo de la opinión pública, disponiendo de los equipos necesarios para el control de la calidad en el levantamiento y procesamiento de información producto de encuestas.